京王電鉄新宿駅では、午前９時発売の記念パスモを買おうと、約２００人が行列をつくった。パスモで京王線を利用した会社員の土田聡子さん（２７）は「便利ですね。私鉄の利用が多いのでスイカは持ってなかったけど、パスモは使いそう」と話した。
大きなトラブルはなかったが、都営地下鉄光が丘駅と東京メトロ豊洲駅で、定期券発売機で磁気の定期をＩＣカードに切り替えようとしたところ間違った定期が発行される不具合が起きた。同じ機械を使っている計７事業者４５１１台の発売機を一時止めて点検した。
パスモとスイカが使えるのは、２７鉄道事業者の１１２路線１６８３駅と、３２バス事業者のバス約４５１台。パスモを運営するパスモ協議会は０９年度末までに８００万枚の発行を目指す。
しかし、一部ルートでは切符よりも割高になる問題も残った。ＪＲ→私鉄・地下鉄→ＪＲ（例、ＪＲ三鷹駅—地下鉄東西線—ＪＲ津田沼駅）の経路がある４地域では、ＪＲ運賃が１０〜１５０円割引になる連絡切符を販売しているものの、スイカやパスモでは同じ割引は適用されない。
ＪＲ東日本によると、割引は切符を対象に適用されるが、ルートそのものにはあてはまらない。バスでも、現在使われている磁気式の共通カードより、割引額が少なくなるケースがある。