捜査員６人は、管財課職員の案内を受け、４階の保健医療部長室に入り、机やロッカーにあった封筒などを押収。このほか、県側から休暇簿や人事記録の任意提出を受けた。中村容疑者の勤務状況に関した資料が主だといい、県の事業に関連する資料は押収されなかったという。
この日は「部長逮捕」から一夜明けての土曜日。保健医療部は各職場から計３０人が出勤し、捜索に協力。総務部からも計６０人が出番となり、警備や情報収集にあたった。
部長級の幹部は「鹿児島時代の事件であり、仕方がない。捜査に粛々と協力するだけだ」と冷静な表情。ある男性職員は「（中村容疑者について）悪いことをするような人ではなかったが、随分と交際範囲の広い人だとの印象は持っていた」と話した。
保健医療部は当面、部長不在となることから、副部長らが業務を代行。重要な案件は、岡島敦子副知事が担当する。１２日の県議会最終日は「部長欠席」のままで迎える見通しだ。
県庁への捜索は、土屋前知事の長女による事件に関して行われた２００３年７月以来。また、厚生省（当時）から出向していた元県高齢者福祉課長が、９６年１１月に収賄容疑で逮捕された際にも捜索を受けた。